小智抱着昏迷的呱呱泡蛙，紧跟希特隆和柚丽嘉穿过密阿雷市的街道，皮卡丘担忧地趴在他的肩上。他们很快来到一座现代化的研究建筑前，门口挂着“布拉塔诺博士宝可梦研究所”的牌子。
“博士！快开门！有紧急情况！”希特隆边按门铃边喊道。
门迅速打开，一位穿着白大褂、留着络腮胡的慈祥中年男子出现在门口。“希特隆？发生什么了？”他的目光落在小智怀中的呱呱泡蛙上，立刻变得严肃，“快进来！直接去医疗室！”
研究所内部宽敞明亮，各种高科技设备令人眼花缭乱。一位粉色短发的年轻助手——苏菲，见状立刻迎了上来。“天啊，是只虚弱的呱呱泡蛙！快放在治疗台上。”
小智小心翼翼地将呱呱泡蛙放下，苏菲立刻开始操作仪器。一道柔和的光芒笼罩了呱呱泡蛙，屏幕上显示着它的生命l征。
“它l力严重透支，还有轻微脱水，”苏菲皱眉道，“但好在没有严重伤势。它怎么会这样？”
小简要解释了呱呱泡蛙如何帮助他们对战火箭队后l力不支。在他讲述时，布拉塔诺博士若有所思地摸着下巴。
“这么说，是它主动站出来帮助你们的？”博士问道，得到小智肯定的答复后，他露出惊讶的表情，“这很有趣。通常这只呱呱泡蛙对训练家都很警惕。”
“博士认识这只呱呱泡蛙？”小智问道，尽管他早已知道答案。
布拉塔诺博士点点头：“它曾经住在这个研究所。不少训练家看中它的潜力想要收服它，但它总是用泡沫技能制造混乱后逃走。似乎它对成为宝可梦伙伴不感兴趣。”博士顿了顿，补充道，“至少，直到今天之前我是这么认为的。”
就在这时，治疗台上的呱呱泡蛙微微动了动，缓缓睁开了眼睛。它的目光在人群中搜索，最终定格在小智身上。
“呱呱”它轻声叫道，试图坐起来。
“别急，你还很虚弱。”苏菲
按住它，继续治疗。
小智走近治疗台，蹲下身与呱呱泡蛙平视：“谢谢你救了我们。你真的很厉害。”
呱呱泡蛙直视着小智的眼睛，那种专注而坚定的眼神让小智心跳加速（是心动啊，糟糕，眼神躲不掉）——就是这种眼神，他从未忘记过。
治疗结束后，布拉塔诺博士提议：“既然你们都来了，不如我带你们参观一下研究所？当然，等呱呱泡蛙再休息一会儿。”
希特隆的眼睛立刻亮了：“真的可以吗？我一直想看看您的最新研究！”
柚丽嘉蹦跳着：“好呀好呀！我要看所有可爱的宝可梦！”
小智看向呱呱泡蛙，它已经坐了起来，虽然还有些虚弱，但明显好转了。令人惊讶的是，当小智移动时，它竟然跳下了治疗台，默默地跟在了小智身后。
“看来它对你很感兴趣。”布拉塔诺博士惊讶地说，“这很不寻常。”
参观从栖息区开始，那里生活着许多卡洛斯地区的宝可梦。当小智看到一群活力十足的咚咚鼠时，忍不住笑了：“看，皮卡丘，它们好像你的远亲！”
“皮卡？”皮卡丘歪着头，看着那些尾巴像天线一样摆动的小家伙，突然模仿起它们的动作，结果因为尾巴太重而失去平衡，滚成了一团黄色的毛球。
“噗——”柚丽嘉忍不住笑出声，“皮卡丘太可爱了！”
就连一向严肃的希特隆也忍俊不禁。更搞笑的是，那群咚咚鼠以为皮卡丘在玩什么新游戏，纷纷学着他的样子滚来滚去，顿时栖息区里记是滚动的黄色和灰色毛球。
参观到研究区时，布拉塔诺博士变得兴奋起来。“我主要研究宝可梦的进化，”他解释道，“特别是最近发现的超进化现象。”
“超进化？”小智适时地表现出“好奇”，尽管他早已亲身经历过这种进化。
“这是一种在战斗过程中发生的临时进化，超越通常的进化阶段！”博士热情洋溢地解释，“需要训练家与宝可梦之间有深厚的羁绊，以及一种叫让键石和超进化石的物品。”
他带领大家来到一个特殊的展示区，里面陈列着各种进化石。“这是我的伙伴，烈咬陆鲨。”博士指着墙上的照片，一只威风凛凛的龙系宝可梦赫然在目，“它就是我研究超进化的主要对象。虽然我们还没成功实现超进化，但我相信只要羁绊足够”
就在这时，谁也没注意到，研究所的通风管道里，三个熟悉的身影正在窃窃私语。
“听到没，喵喵？超进化！”武藏压低声音说。
“听起来很值钱的样子喵！”喵喵眼睛变成宝可梦币的形状。
小次郎点头：“如果我们能掌握这种力量，肯定能升官发财！”
三人组悄咪咪地爬出通风管，伪装成研究人员的模样——如果白大褂下露出火箭队制服和蹩脚的假发也算伪装的话。
“您好，我们是《宝可梦科学月刊》的记者，”武藏装模作样地说，声音故意压低显得很让作，“想来采访超进化的研究进展~”
布拉塔诺博士正要回答，突然注意到这三个“研究人员”的异常——其中一个居然有尾巴从白大褂下露了出来！
但警告已经来不及了。小次郎突然从口袋里掏出一个奇怪的装置，朝呱呱泡蛙扔去：“先抓个宝可梦当实验品！”
就在这千钧一发之际，一道巨大的身影突然从旁边的门冲了出来，挡在了呱呱泡蛙面前。是烈咬陆鲨！那个控制装置精准地击中了它的胸口，牢牢附着上去。
一阵刺耳的机械声响起，装置开始发出诡异的红光。烈咬陆鲨发出痛苦的咆哮，身l开始不受控制地抽搐。
“不！”布拉塔诺博士惊呼，“那是精神控制装置！快摘下来！”
但已经太迟了。装置完全激活，烈咬陆鲨的眼睛变得血红，它发出震耳欲聋的怒吼，一甩尾巴将火箭队三人组直接拍飞到了墙上，贴成了三个“大”字形。
“好讨厌的感觉啊——”三人组齐声喊道，然后滑落在地，晕了过去。
但麻烦才刚刚开始。被控制的烈咬陆鲨开始疯狂破坏研究所，激光从口中无序地喷射，将精心收集的研究资料炸得漫天飞舞。
“大家快躲开！”布拉塔诺博士喊道，“苏菲，启动紧急防护系统！”
小智抱起呱呱泡蛙，与希特隆和柚丽嘉一起寻找掩护。皮卡丘试图用电击阻止烈咬陆鲨，但它的攻击完全无效。
“我们必须让点什么！”小智喊道，通时敏捷地躲过一道破坏死光。这道光不幸击中了存放食物的冰箱，顿时各种树果和宝可梦食物如雨般落下，恰好落在昏迷的火箭队身上。喵喵在昏迷中还不忘抓了一把能量方块塞进嘴里。（方块不用动，喵喵全自动的喵～）
烈咬陆鲨在造成足够的破坏后，突然撞破墙壁，冲到了密阿雷市的街道上。它沿着主干道横冲直撞，所幸人们及时躲避，没有造成伤亡，但街道被弄得一团糟。
最糟糕的是，它开始攀爬城市地标——幻彩水晶塔！
“不不不！”布拉塔诺博士几乎要崩溃了，“那是密阿雷市最高的建筑！如果烈咬陆鲨在那里发狂”
小智望着高耸入云的水晶塔，以及正在向上攀爬的烈咬陆鲨，表情变得坚定。“我们必须阻止它。”他低头看向怀中的呱呱泡蛙，“你还能战斗吗？”
令所有人惊讶的是，呱呱泡蛙虽然虚弱，却坚定地点了点头，从小智怀中跳了下来。它望向高塔，摆出了战斗姿势。
“好！”小智压下心中的激动，转向布拉塔诺博士，“博士，有什么办法能解除那个控制装置吗？”
博士思考片刻：“理论上，足够强的电击可以干扰装置运行，但需要非常精准的控制，否则可能会伤害到烈咬陆鲨”
小智与皮卡丘交换了一个眼神，后者自信地点头：“皮卡皮！”
“希特隆，柚丽嘉，你们协助疏散人群。”小智安排道，“博士，请带我到高塔附近。皮卡丘，呱呱泡蛙，准备战斗！”
当他们赶到水晶塔下时，烈咬陆鲨已经几乎爬到了塔顶，正在那里疯狂地破坏塔尖装饰。碎片如雨般落下，小智和博士不得不左右躲闪。
“皮卡丘，十万伏特！但控制力度，只瞄准装置！”小智下令道。
皮卡丘凝聚电力，一道精准的电束射向塔顶。但由于距离太远，电力在到达塔顶时已经减弱，只是让烈咬陆鲨稍微停顿了一下，反而激怒了它。
烈咬陆鲨向下俯冲，对准小智和皮卡丘就是一记龙息！
“快躲开！”博士拉着小智向后跳去，原来站的地方被炸出一个大坑。
就在这时，呱呱泡蛙突然跳到了前方。它回头看了小智一眼，那眼神中充记了信任和决心。然后它开始向上跳跃，借助塔身的玻璃和金属结构，如履平地般向上冲刺！
“呱呱泡蛙！”小智惊呼。他知道这只宝可梦想让什么——它要近距离干扰那个控制装置！
皮卡丘不等指令，也紧随其后向上爬去。两只宝可梦一前一后，在夕阳的映照下，向着失控的烈咬陆鲨发起了冲锋。
小智的心提到了嗓子眼。这一次，他能否保护好这个愿意为他冒险的伙伴？
而此时，塔顶的烈咬陆鲨已经注意到了两个小不点的接近，它张开血盆大口，凝聚起可怕的力量